Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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