Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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