Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.215e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 LRRC41-204ENST00000496156 892 ntTSL 513.57□□□□□ -0.245e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.375e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 LRRC41-203ENST00000472710 4455 ntTSL 211.38□□□□□ -0.595e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.874e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.254e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-211ENST00000493230 1114 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.154e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.84e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.84e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.64e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-14■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-13■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.733e-13■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 39.68□□□□□ -0.863e-13■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.542e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.892e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.772e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RPL18-210ENST00000550671 764 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-46■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.662e-17■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NDUFA13-205ENST00000511180 593 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-9■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 PCYT2-211ENST00000572924 732 ntTSL 218.01■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-226ENST00000585188 863 ntTSL 315.15■□□□□ 0.025e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-217ENST00000578267 582 ntTSL 314.71□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-218ENST00000579445 582 ntTSL 39.71□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-225ENST00000584479 572 ntTSL 29.68□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-221ENST00000581380 456 ntTSL 39.66□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MPDU1-214ENST00000576066 491 ntTSL 39.66□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.92e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-212ENST00000465449 1739 ntTSL 221.2■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-204ENST00000417962 2306 ntTSL 220.72■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-216ENST00000494854 1908 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 SHISA5-213ENST00000466424 673 ntTSL 213.58□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.073e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.013e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.715e-9■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 519.24■□□□□ 0.675e-9■■■■□ 19.8
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PABPC4Q13310 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt20.04■□□□□ 0.84e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-8■■■■□ 19.8
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PABPC4Q13310 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 ASNS-213ENST00000454046 1947 ntTSL 59.56□□□□□ -0.884e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.974e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RPL15-212ENST00000490223 1785 ntTSL 222.54■■□□□ 1.25e-10■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.135e-10■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 RPL15-211ENST00000465786 1729 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.565e-10■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.71e-13■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.013e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EXOC3-202ENST00000503889 5365 ntTSL 518.8■□□□□ 0.63e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EXOC3-210ENST00000515601 5748 ntTSL 517.74■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.387e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EMC1-203ENST00000461353 2175 ntTSL 212.22□□□□□ -0.457e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 EMC1-208ENST00000480380 3892 ntTSL 28.16□□□□□ -1.17e-19■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SUPT6H-206ENST00000581510 1194 ntTSL 520.49■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-210ENST00000601387 497 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-204ENST00000595636 487 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-205ENST00000596583 490 ntTSL 39.28□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-211ENST00000601731 405 ntTSL 37.89□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-203ENST00000595207 526 ntTSL 37.05□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 STT3A-207ENST00000526364 617 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.777e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 222.87■■□□□ 1.257e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.037e-7■■■■□ 19.7
PABPC4Q13310 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 221.2■□□□□ 0.997e-7■■■■□ 19.7
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