Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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