Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK1P06493 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK1P06493 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms