Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PRNT-201ENST00000326539 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CACNB1Q02641 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms