Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2J1Q9Y385 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms