Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms