Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms