Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDO1Q16878 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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