Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FIP1L1-204ENST00000504094 2177 ntTSL 25.71□□□□□ -1.51e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 55.47□□□□□ -1.531e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-211ENST00000513008 1070 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.711e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.75e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.137e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.547e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 SNRPC-204ENST00000474635 511 ntTSL 59.54□□□□□ -0.887e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-202ENST00000463880 641 ntTSL 322.88■■□□□ 1.256e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.066e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-208ENST00000495354 495 ntTSL 313.63□□□□□ -0.236e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-207ENST00000493378 548 ntTSL 311.99□□□□□ -0.496e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.166e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-204ENST00000486310 1601 ntTSL 37.7□□□□□ -1.186e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-205ENST00000488156 732 ntTSL 37.49□□□□□ -1.216e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.56e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ARF4-203ENST00000483848 404 ntTSL 53.39□□□□□ -1.876e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 UNC13D-212ENST00000589670 668 ntTSL 319.79■□□□□ 0.768e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.318e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.468e-8■■■□□ 15
PCBP1Q15365 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.546e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.113e-7■■■□□ 15
PCBP1Q15365 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.242e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 15
PCBP1Q15365 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 15
PCBP1Q15365 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■■□□ 15
PCBP1Q15365 MAN2A2-229ENST00000561240 460 ntTSL 419.21■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 MAN2A2-224ENST00000560616 988 ntTSL 518.05■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 MAN2A2-205ENST00000558171 790 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 MAN2A2-222ENST00000560505 643 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 MAN2A2-220ENST00000560192 2469 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 15
PCBP1Q15365 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 328.1■■■□□ 2.093e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 322.42■■□□□ 1.183e-9■■■□□ 15
PCBP1Q15365 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.799e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 522.96■■□□□ 1.279e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.99e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 320.63■□□□□ 0.899e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 220.57■□□□□ 0.889e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-212ENST00000596750 906 ntTSL 319.74■□□□□ 0.759e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 218.21■□□□□ 0.519e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.11■□□□□ 0.331e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 522.01■■□□□ 1.111e-17■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CROCCP2-203ENST00000635081 1904 ntTSL 521.77■■□□□ 1.081e-17■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.721e-17■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.551e-17■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 518.02■□□□□ 0.471e-17■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 521.47■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.481e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-12■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.036e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -06e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.426e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.816e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.216e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.256e-21■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.232e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.332e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 522.64■■□□□ 1.212e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 522.4■■□□□ 1.182e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 BCL2L2-205ENST00000557236 631 ntTSL 522.05■■□□□ 1.124e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MOGS-204ENST00000448666 1616 ntTSL 1 (best)20.59■□□□□ 0.894e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PLOD3-213ENST00000478264 663 ntTSL 220.07■□□□□ 0.84e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-12■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GAMT-204ENST00000640164 520 ntTSL 217.5■□□□□ 0.394e-9■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-12■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.284e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 BCL2L2-206ENST00000557579 596 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 515.91■□□□□ 0.144e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-203ENST00000370963 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.084e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.17■□□□□ 0.024e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-12■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-12■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 BCL2L2-202ENST00000553824 548 ntTSL 413.77□□□□□ -0.214e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-9■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 LSR-208ENST00000599658 343 ntTSL 313.13□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-204ENST00000457564 379 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 212.96□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 TKFC-221ENST00000534370 360 ntTSL 212.8□□□□□ -0.364e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-205ENST00000477599 1127 ntTSL 312.04□□□□□ -0.484e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 LINC01341-204ENST00000505748 595 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 CNNM3-203ENST00000465224 2607 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PHYHIPL-204ENST00000486074 1971 ntTSL 29.98□□□□□ -0.814e-9■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-202ENST00000370960 859 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-7■■■□□ 14.9
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