Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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