Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF9Q13886 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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