Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR29P0C7W0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRR29P0C7W0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms