Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD4P09016 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms