Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms