Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN18-201ENST00000183605 3520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF512-204ENST00000416005 3515 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-202ENST00000376450 3355 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY4-201ENST00000310677 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT5-201ENST00000261249 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD6-202ENST00000392328 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP12-202ENST00000345770 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF26-201ENST00000356448 5254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCOCO1-202ENST00000430117 2706 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01597-201ENST00000380888 4472 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB2-202ENST00000374630 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH2-203ENST00000447098 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 JAM2-206ENST00000480456 4337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOXE3-203ENST00000448843 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEC1-202ENST00000346219 5490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms