Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP69-201ENST00000389297 3902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-263ENST00000637806 7061 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4697HG-201ENST00000624667 5164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY4-204ENST00000554068 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF5-201ENST00000249375 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC037441.1-202ENST00000511897 3879 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM51-AS1-201ENST00000310916 7100 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5K-203ENST00000406424 3194 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT10-201ENST00000228567 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGFR-201ENST00000370756 4450 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF2-204ENST00000441159 5568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STYX-201ENST00000354586 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SGSM1-202ENST00000400359 4317 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GNA12-202ENST00000407653 3785 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CIITA-202ENST00000381835 2344 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC046168.1-201ENST00000561283 3814 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-205ENST00000392004 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B3-203ENST00000359149 4234 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005131.6-201ENST00000587344 4215 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA5B1-202ENST00000375079 3859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms