Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPECC1-205ENST00000395529 4971 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GH2-201ENST00000332800 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079602.1-201ENST00000412750 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRYP2-201ENST00000416652 492 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005006.1-201ENST00000432130 249 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM1P24-201ENST00000441091 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL772155.3-201ENST00000444097 578 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDX2P1-201ENST00000450181 589 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL400P-201ENST00000473634 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL584P-201ENST00000492309 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPCP16-201ENST00000506029 210 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPCP17-201ENST00000520330 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUBB4BP4-201ENST00000527023 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC134684.1-201ENST00000533883 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEBOX-201ENST00000536498 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL079307.2-201ENST00000557308 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010615.4-201ENST00000600810 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUSC8-202ENST00000607312 628 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.204-201ENST00000611908 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL428P-201ENST00000613848 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCL17-202ENST00000616880 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL331P-201ENST00000618054 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000457.1-201ENST00000620221 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6742-201ENST00000622338 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TULP3-201ENST00000397132 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLA2G4E-201ENST00000399518 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPM1A-202ENST00000325658 4125 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR1B-217ENST00000541869 5059 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSL6-202ENST00000357096 6298 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM30-201ENST00000369400 2963 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRD1-203ENST00000369282 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TWF1-211ENST00000552521 3012 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP16-1-201ENST00000391352 1554 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTPAL-201ENST00000262605 6212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA12-201ENST00000341228 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHC1P1-201ENST00000554937 3061 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH4-202ENST00000611855 3304 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-232ENST00000637417 5114 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN3A1-202ENST00000289361 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPSTI1-202ENST00000313640 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms