Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms