Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms