Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C2orf88Q9BSF0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C2orf88Q9BSF0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms