Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms