Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KRTAP27-1Q3LI81 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms