Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC6Q16204 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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