Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BECN1Q14457 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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