Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LCP2Q13094 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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