Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBP2P56545 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms