Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND2P52198 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RND2P52198 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RND2P52198 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND2P52198 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND2P52198 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND2P52198 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms