Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms