Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms