Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM21P19474 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms