Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD53P19397 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD53P19397 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms