Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPZ2Q9P299 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ2Q9P299 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ2Q9P299 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ2Q9P299 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ2Q9P299 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPZ2Q9P299 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms