Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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