Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 29.88□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 YBX3-212ENST00000542002 952 ntTSL 29.82□□□□□ -0.847e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 IST1-216ENST00000539186 542 ntTSL 49.81□□□□□ -0.842e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 TXNRD1-207ENST00000525265 572 ntTSL 29.76□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOL8-209ENST00000445919 1044 ntTSL 59.74□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.854e-9■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 KIAA1586-202ENST00000488682 701 ntTSL 39.68□□□□□ -0.867e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-9■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.867e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CHD4-207ENST00000537634 691 ntTSL 29.64□□□□□ -0.877e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-10■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.874e-9■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOL8-205ENST00000432670 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.53□□□□□ -0.887e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 LARP1B-207ENST00000507377 1593 ntTSL 29.49□□□□□ -0.897e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SPOP-216ENST00000509869 779 ntTSL 59.45□□□□□ -0.97e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 29.45□□□□□ -0.96e-10■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-232ENST00000551661 571 ntTSL 49.42□□□□□ -0.97e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 LBR-205ENST00000425080 874 ntTSL 39.37□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EYA3-207ENST00000495923 833 ntTSL 59.34□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.927e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 29.25□□□□□ -0.937e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EYA3-201ENST00000373863 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.937e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 FXR1-206ENST00000465551 572 ntTSL 49.23□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 IST1-204ENST00000424485 521 ntTSL 49.19□□□□□ -0.942e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PLAGL1-214ENST00000626373 333 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.947e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CHD4-212ENST00000545083 511 ntTSL 39.15□□□□□ -0.947e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 49.1□□□□□ -0.957e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DST-209ENST00000449297 2108 ntTSL 59.1□□□□□ -0.955e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.967e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-207ENST00000547867 571 ntTSL 48.98□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 GNAS-254ENST00000494081 557 ntTSL 58.94□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PRMT7-208ENST00000563443 540 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-17■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 IST1-224ENST00000566536 612 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -17e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 AP4B1-210ENST00000479285 1940 ntTSL 28.82□□□□□ -17e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -17e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -17e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 ANKHD1-219ENST00000506930 632 ntTSL 38.74□□□□□ -1.017e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SNRNP70-208ENST00000599687 563 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-225ENST00000550641 964 ntTSL 58.66□□□□□ -1.027e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-208ENST00000548021 724 ntTSL 28.66□□□□□ -1.027e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 YBX3-208ENST00000540447 6393 ntTSL 28.66□□□□□ -1.027e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.037e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PABPC1-202ENST00000517403 560 ntTSL 58.58□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DAXX-208ENST00000477162 847 ntTSL 58.56□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 VRK1-206ENST00000557222 1029 ntTSL 58.54□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 38.48□□□□□ -1.051e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.057e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SF1-219ENST00000496969 455 ntTSL 38.45□□□□□ -1.067e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PRMT7-210ENST00000563562 487 ntTSL 58.43□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.087e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 58.31□□□□□ -1.087e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PRMT7-204ENST00000561806 543 ntTSL 58.25□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.097e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 FDPS-218ENST00000492887 554 ntTSL 28.21□□□□□ -1.17e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DST-224ENST00000521821 735 ntTSL 28.15□□□□□ -1.15e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 58.13□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DYNC1H1-206ENST00000555204 353 ntTSL 38.13□□□□□ -1.117e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DAXX-210ENST00000490173 641 ntTSL 1 (best)8.04□□□□□ -1.127e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.137e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 GNAS-251ENST00000492907 790 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.88□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.157e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 47.83□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 47.81□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 UQCRC2-204ENST00000563711 2008 ntTSL 27.81□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.167e-7■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt7.79□□□□□ -1.167e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.164e-9■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 N4BP2L2-214ENST00000511143 816 ntTSL 37.75□□□□□ -1.177e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.174e-9■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.187e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CCNL1-218ENST00000476744 1029 ntTSL 27.69□□□□□ -1.187e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.187e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 N4BP2L2-210ENST00000503814 5317 ntTSL 1 (best)7.64□□□□□ -1.197e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 27.6□□□□□ -1.197e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 POLR2C-205ENST00000563589 458 ntTSL 47.58□□□□□ -1.27e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.27e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.217e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 OSTC-203ENST00000510556 331 ntTSL 57.51□□□□□ -1.217e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.217e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-217ENST00000549443 457 ntTSL 47.46□□□□□ -1.227e-6■■■■□ 24.6
RBM22Q9NW64 CNOT2-237ENST00000552319 783 ntTSL 57.46□□□□□ -1.227e-6■■■■□ 24.6
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 101.2 ms