Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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