Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 PPL-206ENST00000592772 3615 ntTSL 512.18□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 410.35□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 51.4
TBRG4Q969Z0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 51.3
TBRG4Q969Z0 NOS1AP-202ENST00000430120 1732 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 51.3
TBRG4Q969Z0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 51.3
TBRG4Q969Z0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SERINC5-204ENST00000512972 1627 ntTSL 223.7■■□□□ 1.384e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SERINC5-206ENST00000632581 1573 ntTSL 223.57■■□□□ 1.364e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.354e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.324e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.284e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 522.23■■□□□ 1.154e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.154e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 222.05■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.784e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.784e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.714e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 WWP1-210ENST00000523863 796 ntTSL 319.39■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-210ENST00000522397 852 ntTSL 319.2■□□□□ 0.664e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 518.74■□□□□ 0.594e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 318.73■□□□□ 0.594e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.584e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 218.12■□□□□ 0.494e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DRG1-202ENST00000416465 612 ntTSL 517.73■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DDB1-205ENST00000535174 896 ntTSL 316.82■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-223ENST00000479383 873 ntTSL 316.49■□□□□ 0.234e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-216ENST00000479566 501 ntTSL 316.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DDB1-215ENST00000539712 1020 ntTSL 216.24■□□□□ 0.194e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ZCCHC11-214ENST00000484723 2910 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.174e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.124e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-206ENST00000557576 656 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 314.69□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-206ENST00000526151 557 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.114e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 214.27□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 314.26□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 IGF2BP1-204ENST00000505562 461 ntTSL 314.23□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 MGRN1-213ENST00000590790 994 ntTSL 514.19□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.264e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 413.13□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DRG1-205ENST00000486584 318 ntTSL 513.1□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ZCCHC11-220ENST00000528642 3854 ntTSL 512.64□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ZNF524-202ENST00000589521 489 ntTSL 312.62□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 212.39□□□□□ -0.434e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 311.99□□□□□ -0.494e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 MAST2-202ENST00000372008 2528 ntTSL 511.7□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CKAP4-202ENST00000552828 831 ntTSL 311.44□□□□□ -0.584e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 MGRN1-217ENST00000593224 498 ntTSL 510.98□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CPEB4-203ENST00000517880 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-220ENST00000461066 692 ntTSL 510.23□□□□□ -0.774e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.834e-11■■■■■ 51
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