Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms