Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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