Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSHL1Q14406 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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