Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms