Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB2Q00722 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB2Q00722 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms