Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms