Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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