Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NDUFS5O43920 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NDUFS5O43920 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NDUFS5O43920 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NDUFS5O43920 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NDUFS5O43920 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NDUFS5O43920 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms