Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATCO43716 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATCO43716 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATCO43716 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms