Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC1Q9Y5R8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC1Q9Y5R8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC1Q9Y5R8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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