Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms