Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL3P36405 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL3P36405 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL3P36405 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL3P36405 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms